- Alder: 72 (død)
- Født:6. Januar
- Nogle gode jutsoerIzanagi, Kuchiyose no Jutsu, Futon: Shinkujin, Ura Shisho Fuinjutsu
- Kekkei Genkai: Mokuton (Træ Manipulation), Sharingan, Mangekyo Sharingan
- Klan: Ingen
- Loyalitet: Konohagakure, Roden
- Chakra naturer: Futon, (Vind Manipulation), Suiton (Vand Manipulation), Doton (Jord Manipulation), Mokuton (Træ Manipulation), Yin, Yang.
- Ninja rank: Kage
Danzo Shimura er lederen af "Roden", hvor hans elev Sai også var med. Han blev misundelig på Hiruzen Sarutobi, da han blev den 3 Hokage, Og derfor har han hadet den 3 Hokages ideer. Senere stiller han op for at blive den 6 Hokage og det lykkes for ham, men han bliver dræbt af Sasuke Uchiha.
Danzō besidder Shisui Uchiha's Sharingan på sit højre øje, hvilket han har skjult under bandager. Det er nok skadet, men påtrods af dette kan Danzo sagtens bruge det, som da han opdager nogle snigmordere i en skov.
Danzō's arm tilhørte også Shisui Uchiha, men den er blevet lavet meget om. Danzō viser, at han har mange af Sharingan øjne på armen, som han holder forsejlet med jernbeslag, så de ikke bruger hans chakra, indtil han får brug for dem. Øjnene har han nok fået fra Uchiha slægtens massakre og Danzo bruger de 10 Sharingan til den forbudte Dojutsu (øjenkunst) Izanagi, som er forbudt selv i Uchiha klanen. Jutsuen kan styre det rum mellem virkelighed og illusion. Det er den mest kraftfulde Genjutsu nogen kan kaste på sig selv. Men efter man har brugt Izanagi lukker øjet og det åbner aldrig igen.
Det nye Team 7[]
Danzo sætter Sai på Team 7 som erstatning for Sasuke Uchiha. Pågrund af dette gør Tsunade Yamato til holdkaptajn, så han kan holde øje med Sai, i tilfælde af, at Danzo har andre planer med ham. Under missionen får Sai kontakt med Orochimaru og tilbyder, på vejne af Danzo, at de bør arbejde sammen om at ødelægge Konoha. Yamato opdager det og vil bruge det som bevis for, at Danzo ikke arbejder for Konoha længere, men finder senere ud af, at det kun var for, at Sai kan komme tæt på Sasuke og dræbe ham. Da dette mislykkes og Sai bliver mere knyttet til Team 7 fortæller Danzo ham, at "følelser fører til had, og had fører kun til krig".
Ny Hokage[]
Efter invasionen mødes lederne fra Ildlandet og Konohagakure til et krisemøde. Tsunade, som er den 5. Hokage, er nu i koma. Danzō overbeviser daimyoen (en slags konge) om, at de tidligere Hokager har været dårlige, og har gjort landets militær dårligt. Byen har brug for en stærk og sikker leder, som vil bringe orden tilbage til landet - Noget kun han kan gøre, mener Danzo selv. Efter en kort debat beslutter daimyo'en, af Danzo skal blive den Sjette Hokage. Efter at have læst brevet fra Raikage A, er Danzo første ordre at gøre Sasuke til en missing-nin og han skal dræbes.