Ein Kekkei Genkai (血継限界, Vererbte Fähigkeit) ist eine spezielle Fähigkeit, die von verschiedenen Clans vererbt wird. Diejenigen mit einem Kekkei Genkai erhalten Fähigkeiten, die ihnen im Kampf große Vorteile verschaffen können, da ihre Fähigkeiten teilweise abnormal gegenüber denen normaler Shinobi sind. Kekkei Genkais können nicht kopiert oder erlernt werden, da es sich um ein bestimmtes Gen in der DNS handelt, das nur vererbt werden kann. Jedoch kann man Dou-Jutsus durch ein medizinisches Jutsu transplantieren, um somit diese Fähigkeiten zu benutzen. Dabei ist eine Weitervererbung an die Nachkommen nicht gegeben, da immer noch das Gen im DNS-Strang fehlt.
Früher, vor allem im Wasser-Reich, fanden viele Bürgerkriege statt. Diejenigen mit einem Kekkei Genkai wurden sehr häufig eingesetzt, um die Kriege zu beenden. Auf Grund ihrer besonderen Fähigkeiten war das für sie auch kein Problem, jedoch wurden sie bald von den anderen Menschen als eine Art Unheil angesehen, da es hieß, sie würden immer nur den Krieg bringen. Auch bekamen die meisten Menschen Angst vor denen mit einem Kekkei Genkai. Da ihre Fähigkeiten im Vergleich zu denen eines normalen Menschen abnormal waren, wurden sie oft für Monster gehalten. Aus diesen Gründen wurden sehr häufig Menschen mit Kekkei Genkais getötet.
Im Laufe der Zeit änderte sich die Einstellung zu Menschen mit einem Kekkei Genkai. Sie wurden vor allem in den großen Shinobi-Dörfern hoch angesehen, da sie auch schwierige Missionen erledigen und das Dorf gut beschützen konnten. Doch auch heute noch werden in vereinzelten Landstrichen Menschen mit Kekkei Genkais aus Angst vor ihnen getötet.
Besitz mehrerer Kekkei Genkai
Früher nahm man an, dass ein Shinobi maximal ein Kekkei Genkai besitzen kann. Doch es ist auch möglich, mehrere zu besitzen. Der Godaime Mizukage ist im Besitz zweier Kekkei Genkai, Futton und Youton. Somit ist es bestätigt, dass ein Shinobi auch mehr als nur ein Kekkai Genkai besitzen kann. Mehrere Shinobi wie Danzou Shimura oder Tobi besitzen ebenfalls mehrere Kekkei Genkais, jedoch sind diese nicht wie bei Mei natürlichen Ursprungs, sondern lediglich implantiert.
Bei OonokisJinton handelt es sich nicht um ein Kekkei Genkai, sondern um ein sogenanntes Kekkei Touta, eine noch seltenere Form des Bluterbes. Die Techniken von Kaguya Ootsutsuki basieren auf dem Kekkei Moura, ebenfalls ein sehr seltenes Bluterbe.