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Naruto Shippuden: Ultimate Ninja 5 (ナルトナルティメットアクセル2, Naruto Shippuden: Narutimatte accel 2) es el segundo juego que abarca la segunda parte de la serie. Presenta un modo RPG que cuenta el inicio de la segunda parte hasta el reencuentro con Sasuke. El plantel aumenta a 62 personajes. Como novedad, hay combates 2 vs 2, en los cuales se realizan ataques combinados (tanto jutsu secreto y especiales, aunque sólo con algunos). Además algunos personajes sufren transformaciones que son irreversibles hasta acabar la batalla. El juego está hablado en japonés tanto en la versión norteamericana como en la europea pero se pueden cambiar los subtítulos.
La historia comienza desde la llegada de Naruto y Jiraiya hasta el reencuentro con Sasuke, abarcando así la saga del Rescate del Kazekage hasta la saga Sasuke.Si haces todas las misiones puedes jugar un modo historia con sasuke,orochimaru y kabuto
Personajes utilizables
Como ya se mencionó antes, el planten de personajes es de 62, siendo éstos:
