Une épée (刀剣, Tôken) est une longue arme à lames utilisée pour le combat. Alors que la plupart des épées dans Naruto sont des katana, des tantô, ou des ninjatô traditionnels, les épées utilisées par les personnages principaux ont tendance à avoir peu de ressemblance avec les armes de la vie réelle, comme c'est le cas avec les épées des Sept Épéistes de la Brume. D'autres épées qui ont été introduites dans la série ont des pouvoirs mystiques ou spéciaux, comme l'épée de Kusanagi d'Orochimaru et l'épée de Totsuka détenue par le Susanô d'Itachi Uchiwa.
La plupart des Shinobi semblent avoir une préférence pour les lames longues et larges tandis que certains ninja comme Tenten utilisent des épées plus courtes, principalement pour les jeter à longue portée. Il faut remarquer que les samouraïs du Pays du Fer sont presque tous vus avec des épées, et les shinobi du Pays de la Foudre qui sont une majorité à en porter une. Une épée considérée comme appartenant à un porteur en particulier est connue sous le nom de Meitô (名刀, signifiant littéralement : Célèbre/Excellente Épée).
Certains pays étrangers utilisent des types d'épée plus occidentalisés, tels que l'armée du royaume du Pays de la Lune utilise soit des sabres ou des spathas, tandis que les gardes de Shion dans le Pays des Démons manient des spathas aussi.