שם הסדרה – נארוטו שיפודן. מבוסס על – המאנגה נארוטו מאת מאסאשי קישימוטו. תאריך פרק הפתיחה של האנימה - 15 לפברואר 2007. נארוטו שיפודן – האתר הרשמי.
ידוע במאנגה כחלק השני, ובאנימה כשיפודן (תרגום חופשי למסעות ההוריקן). החלק השני מהווה קפיצת זמן של שנתיים מקו העלילה, ומתחיל בדיוק עם חזרתו של אוזומאקי נארוטו לקונוהאגאקורה, לאחר אימונים עם הסאנין האגדי, ג'ראייה. חלק זה מתחיל במאנגה בצ'אפטר 245, ובאנימה לאחר פרק 220 באנימה של נארוטו. החלק השני מתרכז בעיקר בניסיונותיו של נארוטו להחזיר את אוצ'יהא סאסוקה, עריק מהכפר, בחזרה לקונוהא, ואף חושף דמויות חדשות. בד בבד, ארגון הפשע אקאטסוקי מתחיל לפעול בשביל מימוש משימתם; לכידת הביג'ואים. כמו כן, נארוטו מתגלה כיחידי שנשאר בדרגת.