Ootsutsuki Indra leszármazotjai alkotják.
Lázadás a falu ellen[]
A történet elött 12 évvel (Shippudennél 16) Obito(Tobi) megtámadta szülés közben Uzumaki Kushinát és a férjét a Negyedik Hokagét. A harc során Obito megidézte a Kilencfarkút és Konohára uszította.Obitó-t egyedűl csak Minato látta, ezért a harc végén meghalt, illetve a Obitónak is nyoma veszett, a falu vezetősége az Uchihákat vádolta a tettel. A klán ezután titokban lázító gyűléseket tartott, melynek célja a Konohától való elszakadás volt, mely egy polgárháborúhoz vezetett volna. Ez idő alatt a klán területe teljesen kihaltá vált a falu lakóinak számára.
Az Uchiha mészárlás[]
Danzo, a Gyökér vezetője azzal a magánfeladattal bízta meg Uchiha Itachit, hogy egy éjszaka lefolyása alatt iktassa ki a klán összes tagját, hogy ezzel megelőzzék a polgárháborút. Itachi a maszkos, Uchiha Obitótól kért segítséget. Itachi csak a kistestvérének, Uchiha Sasukénak hagyta meg az életét. Ezek után a klán területét lebontották. A rendfenttartás feladatát meg már nem csak egy klán kezében tartották.