I Chunin (中忍, Chūnin) sono ninja che hanno raggiunto un livello di maturità e abilità che consiste principalmente in capacità di leadership e abilità tattiche. I chunin vengono generalmente inviati in missioni di grado C o B. Alcuni chunin, come Iruka Umino e Shino Aburame, passano a diventare insegnanti dell'Accademia.
Per diventare un chunin, i genin partecipano a un ampio esame, noto come esami di chunin. Coloro che superano il test e diventano chunin possono indossare una giacca antiproiettile identificativa che contiene pergamene del ninjutsu. Questo giubbotto non è obbligatorio.
Come risultato dell'era pacifica che i cinque grandi paesi ninja stabilirono dopo la quarta guerra mondiale ninja, il numero di chunin è diminuito.