O Tsukuyomi Infinito é ativado onde o time de Orochimaru estava e capturando todos, incluindo Karin. A técnica de Madara, em seguida, captura-a para drenar seu chakra enquanto está em um profundo sono. Dentro do sonho, Karin vê-se deitada sobre os amparos de Sasuke Uchiha e pede para que o último sorria novamente para ela, como sorriu no passado. Porém, Karin começa se lembrar de seu passado, mais objetivamente do momento quando sua mãe deixou-a para ir a um algum conflito, a fim de protegê-la do flagelo da guerra. Após ter tido esse impacto em sua vida pessoal, ela espera o dia todo do lado de fora de sua residência, esperando que sua mãe volte para serem felizes novamente. Para a infelicidade de Karin, Zōsui retorna sozinho, e levá-a até o Hospital de Kusagakure para ver sua mãe que havia morrido para salvar inúmeras vidas no campo de batalha.
Ela fica perplexa com os fatos e aquilo que estava vendo diante de seus olhos, mas é levada por Zōsui para outro lado do hospital, onde é entrega nas mãos de um médico para salvar outros pacientes com sua técnica de cura. Ela inicialmente parece recusar-se, mas observa que aquilo não adiantaria, deixando-se resistir as mordidas dos feridos. Os dias passam-se, e ela continua retornando ao hospital sob ordens de Zōsui, continuando a tarefa distratante e cansativa. Vendo-se naquela situação triste, ela sente-se como uma arma utilizada apenas para proteger os ninjas de sua vila, imaginando se o mesmo poderia ter ocorrido com sua mãe quando em batalha.
Quando termina sua tarefa nos leitos do hospital, Karin é enviada em uma missão junto de Zōsui e outros dois ninjas, a fim de salvar aqueles que haviam sido derrubados nos confrontos. Após muito tempo após a sua missão de salvar vidas, ela cresce notavelmente e é inscrita nos Exames Chuunin por Zōsui, que afirma que ela deveria vencer estes exames, uma vez que ela era apenas uma migrante ilegal e para que eles pudessem mostrar que Kusagakure é vila forte com habilidades abundantes. Quando inicia-se os exames, Karin é designada à esconder o pergaminho que seu time havia recebido, enquanto seus dois companheiros de equipe partiam em busca de outro, para tentarem concluir a segunda fase nos Exames Chuunin. Embora pareça que conseguiria concluir esta tarefa, ela é atacada por um urso gigante, que para sua felicidade é derrotado por Sasuke Uchiha, tornando-se o amor secreto de Karin a partir daquele momento. No final dos exames, é mostrado que o time de Karin havia sido desclassificado. Mais tarde, em um leito do hospital, ela encontra-se novamente com Zōsui, que diz que ela era uma vergonha para a vila e, se ela fosse realmente uma pessoa leal à vila, ela iria para a Fortaleza do Norte, onde ocorria a guerra entre os ninjas de Kusagakure contra os membros do clã Kaguya.
Vendo-se sem saída, ela aceita ir para o local de batalha, mas novamente cai sobre o trágico destino de salvar vidas com sua técnica. Ela após ter ganhado muitas mordidas, em todas partes de seu corpo, ela acaba sendo pega por dois bandidos, que são derrotados por um ataque rápido de uma cobra de Orochimaru que salva-a e a leva para seu esconderijo de Kusagakure. Durante seu período como uma ninja de Otogakure, ela cresce consideravelmente, e sob as ordens de Orochimaru, ela conhece Juugo no esconderijo do Norte, até que é levada para o esconderijo do Sul e torna-se a líder do mesmo. Em algum período, ela retorna para o esconderijo de Kusagakure para ajudar Kabuto Yakushi em uma cirurgia, onde observa Sasuke Uchiha sendo levado por Orochimaru.
Após o passar dos anos, Orochimaru é morto por Sasuke Uchiha que cria a Hebi a fim de cumprir seu objetivo. Durante os tempos de Hebi, Sasuke luta com Killer B e derrota Danzou Shimura, mas muda de objetivo após os percursos da guerra, visando a destruição em Konohagakure. No entanto, Karin é pega pelos ninjas de Kusagakure sob ordens de Zōsui, mas é atacado pelos companheiros de equipe de Karin e morto, em seguida, por ela. No final do episódio, Sasuke finalmente sorri para Karin.