Jiraiya usando Kekkai Ninjutsu.
Há também várias espécies de animais que fazem uso de kekkai ninjutsu, como o Sapo Prisão do Monte Myōboku que usa a Barreira: Prisão do Sapo Cabaça. Barreiras também foram incorporadas na forma de selos para fins tanto ofensivos como defensivos.
A força e a eficiência das barreiras aparentemente depende do tipo de técnica utilizada para criar a barreira em si e a capacidade dos outros para perceber, insira ou destruir a barreira. O Sanjūroku-jū no Saisei Kekkai, criado por uma matriz sincronizado de vários shinobi, é supostamente capaz de conter um jinchūriki e seu biju, mas foi mostrada para ser incapaz de lidar com os esforços combinados dos dois jinchūriki. No entanto, mesmo as barreiras mais poderosas, destinadas a evitar a deteção por estranhos, podem ser contornadas pelo uso de Ninjutsu de espaço-tempo, como a Kamui de Tobi, que ele usou para acessar o lugar onde Kushina Uzumaki estava dando à luz a Naruto Uzumaki.
Barreiras podem ser usadas para uma variedade de finalidades, tais como a impedir pessoas de fora, como acontece com a barreira de cinco-selo; para evitar que aqueles dentro de sair dos limites da barreira e até mesmo para evitar que os presos dentro do uso de certas técnicas, como foi feito para impedir que Dan Katō utilize a técnica Reika no Jutsu erguendo a Formação das Quatro Chamas Violeta ao redor dele.
Alguma barreira de ninjutsu parece ter um Ninjutsu de espaço-tempo, manipulando a barreira muito continuo do espaço-tempo em si: os exemplos incluem o interior da prisão da cabaça de sapo, que é uma barreira de um mundo diferente, enquanto Kamui transfere o alvo para outra dimensão e a barreira do espaço-tempo, usado a Kunai do Deus Voador do Trovão, que permite à dobra o alvo para o local da outra kunai.
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