Третья Мировая Война Шиноби (яп. 第三次忍界大戦, Дайсанджи Нинкай Тайсен) – третья из четырех мировых войн шиноби, в которую были вовлечены большая часть деревень. Война шла за десять лет до начала повествования и редко освещается
в сериях за пределами Какаши Гайден. Из-за спада национальной мощи царствование Пяти Великих Стран разрушилось. Вдоль их границ постоянно проходили стычки с маленькими нациями. Затяжные конфликты постепенно разгорелись везде и всюду и в определенный момент стали не просто локальными противостояниями, а настоящей глобальной войной. Противоборство вылилось в беспрецедентную войну на истощение, от которой, в виду проблем с военным потенциалом, страдали все нации. Даже в такой великой деревне как Коноха на войну отправлялись совсем юные дети, едва окончившие Академию, и в итоге было многочисленное количество жертв среди подрастающего поколения.
Война
Сражения Конохагакуре и Ивагакуре простирались по Кусагакуре после того, как Ивагакуре захватила Кусагакуре с целью осадить границы Страны Огня. Коренным переломом в пользу Конохи стала успешно выполненная миссия по уничтожению моста Каннаби. Также достоверно известно, что Ивагакуре находилась в конфликте с Кумогакуре, что приводило к неоднократным баталиям между деревнями. Окромя Ивагакуре, Кумогакуре имела проблемы ещё как минимум с Конохагакуре; Минато из Конохи и Эй из Кумо не раз сражались друг с другом. Сунагакуре тоже принимала непосредственное участие в боевых действиях. Кумогакуре и Конохагакуре подписали мирное соглашение после пресловутого дела Хьюга. В ходе этой войны был убит Третий Райкаге и назначен Четвертый. Также немаловажную роль в войне сыграли в Киригакуре, по крайней мере против Конохи – тамошние шиноби запечатали в Рин Нохаре Трехвостого, который по плану должен был вырваться на волю в пределах Конохагакуре. Рин выбрала смерть от рук Какаши, не желая быть использованной против своей родной деревни. Девушка самолично подставилась на Чидори Какаши, не допустив уничтожения Конохи. В результате отряд шиноби Кири был жестоко уничтожен разбитым горем Обито Учихой, который, неведомо для товарищей, выжил под завалом. Вскоре после этого умер легендарный Мадара Учиха, скрывающийся ото всех, но прежде он ввел Обито в курс своего плана по возрождению. Ао из Киригакуре в ходе войны одержал верх над членом клана Хьюга и пересадил себе Бьякуган. В аниме и Третий Цучикаге, и Третий Хокаге устали постоянно идти на жертвы в затянувшейся войне и в конце-концов заключили мирный договор, несмотря на возражения военных советов в своих деревнях. Ооноки, однако, не особо горел желанием принимать мир и согласился только после того, как Минато из Конохи в одиночку расправился с тысячным войском шиноби Ивы, остановив их вторжение.